出向先のB社にて、良い関係を築きながらお仕事をされてきたようですね。そのような場合、ご自身から退職を申し入れたいところですが、やはりまずは出向元であるA社に伝えることが一般的です。ですから、まずはA社に申し入れてください。 その際に、B社に対しては、N.Yさんから退職の意向を伝えたいということを、相談されてはいかがでしょうか?N.Yさんがどのような状況で働かれていたかは、A社の担当者も把握しているでしょうし、了承していただける可能性も高いと思いますよ。
もし、断られた際にも、A社からB社へ退職の件を伝えた後、再度N.Yさんからも、B社の方に直接感謝のお気持ちと、突然退職となることについてのお詫びをされると良いですね。 退職は円満に行なうことが大切ですから、A社ともしっかり相談しながら、進めていただければと思います。